NatureComm西南大学李加纳

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甘蓝型油菜(2n=4x=38,AACC)是来自芸苔(2n=2x=20,AA)和甘蓝(2n=2x=18,CC)之间的种间杂交的重要异源多倍体作物。然而,没有真正的野生油菜种群,他们的起源和改良过程仍不清楚。年3月11日,NatureCommunications杂志在线发表了来自西南大学李加纳课题组与中国农科王晓武课题组及美国佐治亚大学AndrewH.Paterson合作题为“Whole-genomeresequencingrevealsBrassicanapusoriginandgeneticlociinvolvedinitsimprovement”的研究论文。该研究通过重新测序个欧洲油菜种质发现A亚基因组可能是从欧洲萝卜的祖先进化而来的,C亚基因组可能是从花椰菜,西兰花和芥蓝的共同祖先进化而来。此外,通过全基因组关联分析和转录组分析,该研究还发现与改善胁迫耐受性,油含量,种子质量和生态型改善相关的基因,为进一步功能鉴定和遗传改良提供了候选基因。甘蓝型油菜(2n=4x=38,AACC)是来自芸苔(2n=2x=20,AA)和甘蓝(2n=2x=18,CC)之间的种间杂交的重要异源多倍体作物。三个芸苔属二倍体分别为:Brassicarapa(AA,2n=20),Brassicaoleracea(CC,2n=18)和Brassicanigra(BB,2n=16),而三种异源四倍体物种,甘蓝型油菜(AACC,2n=38),芥菜(AABB,2n=36)和芸苔(BBCC,2n=34)分别来自三个中的两个之间的杂交。

该研究选取个欧洲油菜种质进行全基因组重测序,并且将来自两个种子质量不同的欧洲油菜种质的11个组织进行全基因组转录组测序。该研究首先表明欧洲油菜A亚基因组是从欧洲芜菁的祖先进化而来的(下图左边),估计发生在~-年前。另一方面,研究表明甘蓝型油菜C亚基因组从大头菜,花椰菜和花椰菜的共同祖先进化而来(下图右边),说明甘蓝型油菜C亚基因组比A亚基因组具有更复杂的起源。

此外,该研究确定了其改良所涉及的遗传基因座(如下图),而且进一步通过全基因关联分析确认了鉴定了与10个目标性状显着相关的60个位点,其中5个与种子产量相关,3个与长角果长度相关,4个与油含量相关,48个与种子质量相关。此外,该研究的发现为促进具有有利性状的甘蓝型油菜和相关作物的育种提供了基础。

因此,该研究为了解欧洲油菜的起源和改良历史提供了宝贵的资源,并将有助于解剖重要农艺复杂性状的遗传基础。

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