中国农业科学院NatureGenetic

来自中国农业科学院、荷兰瓦赫宁根大学和研究中心、南京农业大学等机构的研究人员证实，在芜菁（Brassicarapa）和甘蓝（Brassicaoleracea）中亚基因组平行选择与形态多样化和作物驯化有关联。这一研究发现发布在8月15日的《自然遗传学》（NatureGenetics）杂志上。

中国农业科学院的王晓武(XiaowuWang)研究员、武剑(JianWu)副研究员及荷兰瓦格宁根大学GuusjeBonnema博士是这篇论文的共同通讯作者。王晓武研究员现主要从事芸薹属和瓜类作物基因组学、芸薹属作物代谢组学研究、雄性不育功能基因组学、基于高通量测序的分子标记开发与分子育种等研究。武剑副研究员则主要从事十字花科植物矿质营养含量的基因克隆和遗传分析，芸薹属作物基因组学研究，芸薹属作物代谢组学研究，基于高通量测序的分子标记开发与分子育种等研究。

芸苔属（Brassicaspecies）是十字花科中重要的一个属，包含卷心菜、芜菁和油菜等许多具有较高营养价值和经济价值的作物，显示出极大的表型变异。进化上,除了十字花科共同经历的γ、β和α古老的基因组多倍化事件外,芸苔属植物基因组均经历了全基因组三倍化复制（whole-genometriplication,WGT)事件，但目前对于其对表型多样化造成的影响仍不是很清楚。

在这篇文章中，研究人员对代表了不同形态的个芜菁及个甘蓝品种进行了重测序，鉴别出了古六倍化亚基因组水平上的一些选择信号。针对显示典型叶球（leaf-heading）性状的卷心菜形态，他们在芜菁内鉴别出了亚基因组间显示平行选择迹象的4个亚基因组位点，在甘蓝中鉴别出了4个这样的位点。14个亚基因组位点经过了选择，并被这两个物种所共享。他们还发现了强力的亚基因组平行选择与块茎形态类型：芜菁和甘蓝的驯化有关联。

这些结果证实，两种芸苔属植物基因组的古六倍化通过趋同亚基因组平行选择旁系同源基因促成了它们多样化形成叶球和块茎形态。

原文摘要：

SubgenomeparallelselectionisassociatedwithmorphotypediversificationandconvergentcropdomesticationinBrassicarapaandBrassicaoleracea

Abstract：Brassicaspecies,includingcropssuchascabbage,turnipandoilseed,displayenormousphenotypicvariation.Brassicagenomeshaveallundergoneawhole-genometriplication(WGT)eventwithunknowneffectsonphenotypediversification.WeresequencedBrassicarapaandBrassicaoleraceaaccessionsrepresentingvariousmorphotypesandidentifiedsignalsofselectionatthemesohexaploidsubgenomelevel.Forcabbagemorphotypeswiththeirtypicalleaf-headingtrait,weidentifiedfoursubgenomelocithatshowsignsofparallelselectionamongsubgenomeswithinB.rapa,aswellasfoursuchlociwithinB.oleracea.Fifteensubgenomelociareunderselectionandaresharedbythesetwospecies.Wealsodetectedstrongsubgenomeparallelselectionlinkedtothedomesticationofthetuberousmorphotypes,turnip(B.rapa)andkohlrabi(B.oleracea).Overall,wedemonstratedthatthemesohexaploidizationofthetwoBrassicagenomescontributedtotheirdiversificationintoheadingandtuber-formingmorphotypesthroughconvergentsubgenomeparallelselectionofparalogousgenes.

（来源：生物通）