百迈客芸薹属文章见刊Naturegen
由中国农业科学院蔬菜花卉研究所及浙江大学分别与百迈客联合攻关的“白菜和甘蓝、芥菜的亚基因组与物种进化联系”科研成果连续见刊于遗传学领域顶级学术期刊《Naturegenetics》。近日,在该成果的发布会上,来自相关领域的大咖与文章作者们,纷纷从不同角度对该项科研成果进行了深入解读。
于军教授:祝贺在基因组学领域辛勤耕耘的科学家们。这两项研究成果不仅对于农业意义重大,对具有相关性状的动物研究也具有重要的启迪意义。期待更多类似科研成果的涌现!视角作为中国基因组领域的奠基人之一,国家科技部重大科学计划转录组研究首席科学家,于军教授在发布会上首先祝贺科学家们取得的成就,并期望在此领域耕耘的科学家们未来有更大的突破与贡献。继而从宏观的角度解读了这一成果的意义,他讲到,包括葫芦科(黄瓜)、茄科植物基因组的解读,为我国农业的发展奠定了科学基础,我们要搜集各科的种质资源,借助于对基因组的理解,挖掘高产相关基因,培育新的品种,他还说道,事实上,每个基础物种的解读,都将对未来农业发展起到促进作用。有了对蔬菜基因组解读的基础,我们就会发现与功能性状、农业性状相关的基因,让我们广大的农民受益,种出高产、高效的蔬菜。
在后来答记者问环节,于军教授再次解读了两篇论文的研究成果,他讲到,从科研角度讲,这两项成果揭示了很多作物都具有的特征—多倍体化。比如在禾本科植物科的小麦,是个非常复杂的多倍体,可以笼统地讲,植物进化的角度,非常突出的特点就是可以形成多倍体的品种,尤其是在家养化的过程中,被人们的需求筛选,禾本科植物主要是筛选种子,蔬菜主要是筛选它的叶子、果实和种子等。对多倍体现象的研究具有重要的意义,它可以让我们了解如何在基因型层面施加影响,从而对某些重要表型进行筛选,比如最终增加作物的产量。
王晓武教授:好的科研成果一定是建立在好的科学思路之上;好的科研成果,需要多个团队的通力合作;选择一家靠谱的服务伙伴尤其重要,事实证明,当初选择百迈客是对的。视角中国农业科学院蔬菜花卉研究所研究员王晓武教授,作为芸薹属白菜基因组论文的通讯作者和芸薹属芥菜基因组论文的并列第一作者对这次合作感触颇多,当《Naturegenetics》或者《Science》上面发表的基因组文章时,不是因为他们花了多少钱,花了多少时间,而是因为他们解决了一个科学上或者应用上很有影响力的问题。白菜、甘蓝、芥菜这些蔬菜作物和粮食作物有很不一样的特点,我们的《Naturegenetics》文章就是解决了它哪能吃,如何有足够收获、足够产量,背后的理论问题。
其次,基因组研究工作会产出大量的数据,首先需要数据准确可靠,更重要的是对这些数据需要深入的解读。得益于百迈客的深厚积淀,我们得到了大量非常可靠的数据,有了这样高质量的数据,我们才可能对它进行分析,以提炼出我们的问题。而且,我们在数据分析过程中还得到了百迈客的大力支持。
还有,基因组解读工作涉及到大量资源的投入、经费的投入,如果有可能的话,尽可能地和相关单位合作,无论是白菜基因组的工作还是芥菜基因组的工作,很重要的经验就是,需要多单位联合。像白菜基因组和甘蓝基因组重测序就是和百迈客及南京农业大学的侯喜林教授等一起合作完成的。因为只有这样,才能凝聚每个单位的优势,提升文章的层次。
杨景华教授:以学习的态度做科研,不怕研究的东西土,只要研究结果有意义自然会受重视。并透漏芥菜论文的最新消息:10月份该研究成果将被《NaturePlants》以“Highlight”的形式发表评论文章。视角杨景华教授是浙江大学蔬菜研究所副所长,芥菜基因组论文的第一作者,他在发布会上讲到,芥菜虽然很普通,但对于其基因组的研究却又重要意义。
第一,解答了芥菜亚基因组起源的问题
此次研究分析出芥菜A基因组是来源于同一个亚种,属于单系起源。并且计算出了芥菜分化的具体时间为3-5万年,除了从群体的角度研究了芥菜亚基因组A起源问题,还从PCA聚类和FixedSNP角度验证了单系起源的结论。
第二,发现了基因表达的dominance现象
通过计算等位基因的表达量,发现在不同的时期,不同组织之间,存在dominance基因,存在dominance的基因经受的选择压力大于Neutral基因,但是小于Subordinate基因。
第三,区分油用芥菜和菜用芥菜的选择与分化
通过对菜用和油用芥菜群体进行选择清除分析,发现dominance的基因被筛选出来的比例较高,同时结合转录组数据,这部分基因在油用和菜用两个群体中差异表达。同时通过上面的分析发现与硫苷,脂类代谢显著相关并且存在dominance的基因组,这些基因在油用、菜用群体中有各自独特基因分型。
另据杨教授透露,有最新消息,鉴于该文章的影响,9月刊载于《Naturegenetics》的芥菜文章,将于10月份以Highlight的形式再上《Natureplants》。
郑洪坤总裁:基因大数据的解读是个比较复杂的事,我们采取了多维度解读。自主开发的百迈客云,可以有效实现基因数据的解读、挖掘与共享,方便科研推进。百迈客愿以开放的心态,期待与各大院校、企业、机构合作,将基因科技应用到生活中,惠泽百姓。视角北京百迈客生物科技有限公司创始人兼CEO,白菜基因组论文并列第一作者—郑洪坤先生,在答记者问中讲到:基因大数据的解读是比较复杂的,我们从多维度进行了研究。我们自主开发的百迈客云平台可以进行基因大数据的解读、挖掘与共享。这次白菜、芥菜两篇论文的数据就收录于百迈客云中,大家可以登录,随意查阅。传统的研究需要标准化的分析,而创新的成果必须建立在个性化分析的基础之上。我们推出的“组学云”,能够帮助我们的科研工作者提高基因大数据挖掘的效率。而且,实现基因研究与应用生态系统的建立,更好地实现科研成果的转化,真正让老百姓感受到基因科技的作用,不是一方就能完成的,需要科研工作者以及各方的共同努力。他还强调,基因产业领域广大,蕴含的机遇也很多,百迈客始终抱有开放的心态,希望与各大科研机构、投资机构和企业合作,更好地把基因科技应用到生活中去,为老百姓谋福祉。
综上,正如于军教授与郑洪坤总裁所言,应用技术创新、突破,让科技成果多面开花,应用到生产、生活中去,造福百姓,服务人民,这才是科研工作者、企业经营者追求的精髓所在。
重要通知另据消息,由百迈客主办的“第三届全国功能基因组学学术峰会”即将于年10月18-19日在北京召开,届时,国际基因领域内顶尖专家学者将再次聚首,共同探讨功能基因的挖掘和大数据的处理,加强交流,促进合作,共享行业盛世。
百迈客基因,为世界创造新的可能
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